Кафедра является одной из первых, открытых университетских кафедр. История кафедры «История Казахстана и культура народов Казахстана» берет начало с кафедры «Марксизма-ленинизма», которая работала в Казахском сельскохозяйственном институте с 1936 года. С 1952 по 1959 год обязанности заведующего кафедры, исполнял доцент С.Т. Жусипбеков. В 1959 году кафедра была реорганизована в кафедру «Истории КПСС и философии». В 1959-1973 годах кафедру возглавлял доцент Ф.Н. Ф.Н. Молдабаев, а с 1973 по 1983 год должность заведующего кафедрой, исполнял профессор Ж.И. Ибраев.

Кафедра «Марксистско-ленинской философии и научного коммунизма» Алматинского зооветеринарного института была основана в 1968 году. Заведующий кафедрой - кандидат филологических наук, профессор Соскин Г.Н., а с 1985 года - Ж.Ж. Молдабеков, С марта 1989 по 1996 гг. кафедру возглавлял д.ф.н. К.М. Мұхамбеталиев. Как отдельная кафедра – кафедра «Истории КПСС» была открыта в Алматинский зооветеринарном институте в 1968г. Первым заведующим кафедрой был ветеран Великой Отечественной войны, доцент К. Сафранков. С 1973 по 1987 годы заведующими кафедрами работали: профессор, Академик Академии наук Республики Казахстан Козыбаев М.К.; Курманбаев А.С.; доцент, член-корреспондент Национальной академии наук Республики Казахстан Садыков Т.С.; к.и.н М.В.Сивенок.

В 1996 году два казахстанских вуза: Казахский сельскохозяйственный институт и Алматинский зооветеринарный институт были объединены в Казахский национальный аграрный университет. В университете образованы кафедры «История Казахстана» и «Философия». Кафедру «Истории Казахстана» возглавил кандидат исторических наук, доцент М.Ж. Абдиров. Кафедру философии - доктор философских наук, профессор Ж.А.Алиев. В 1999 году кафедра была преобразована в кафедру «Истории, философии и политологии», и до 2002 года кафедру возглавлял кандидат философских наук, доцент Х.К. Ахметов.

В 2002г. кафедра была переименована в кафедру «Социально-гуманитарные дисциплины» и с 2002года по 2004 год, ее возглавляла кандидат социологических наук, доцент Абжалиева А.Т. В 2004-2006 гг. кандидат исторических наук Кенжебеков К.К.. С 2006 по 2008 год заведующим кафедрой был доктор социологических наук, профессор М.А. Абишев.

Кафедра «Общественные дисциплины» была создана в сентябре 2008 года в результате слияния кафедр «История и политология» и «Философия и социология». С этого года по 2017 год кафедру возглавлял доктор политических наук, профессор С.М. Борбасов.

В 2017 году в связи с изменениями структурного и кадрового профиля, кафедра переименована в кафедру «История Казахстана и культура народов Казахстана». С 2017 года кафедру возглавляет кандидат исторических наук, профессор, заслуженный работник образования Республики Казахстан Салкынбек Досалы Исаханович.

23 октября 2020 года постановлением Правительства № 707 вузу присвоен статус национального исследовательского университета.

С начала 2020 учебного года кафедру возглавила к.и.н., ассоциированный профессор Актамбердиева Зауре Салкеевна.

На кафедре работают 2 доктора наук, 8 кандидатов наук и 6 старших преподавателей.

Целью преподавателей кафедры является обеспечение студентов качественным образованием, обучением и воспитанием.

Кафедра «История Казахстана и культура народов Казахстана», как и весь университет, ориентируется на элитное образование, то есть подготовку конкурентоспособных и квалифицированных специалистов для общества. Вступление Республики Казахстан в мировое образовательное пространство, предъявляет к высшим учебным заведениям повышенные требования: главной целью и задачей кафедры на предстоящие годы является эффективное участие в развитии Казахского национального аграрного исследовательского университета. В связи с этим миссия кафедры «История Казахстана и культура народов Казахстана» состоит в обеспечении уровня гуманитарной подготовки студентов КазНАИУ, отвечающей современным образовательным стандартам, что позволит выпускникам быть конкурентоспособными во всех сферах деятельности. Кафедре предстоит интегрироваться в единую систему научно-методической, учебно-методической и воспитательной работы университета.

В стратегическом плане кафедры можно выделить следующие ключевые моменты, направленные: на укрепление позиции на рынке прикладных научных исследований; вступление в консорциумы и союзы с ведущими университетами, исследовательскими институтами и центрами Казахстана.